Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CXCR5P32302 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCR5P32302 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms