Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA3P32297 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNA3P32297 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms