Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCR1P32246 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCR1P32246 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR1P32246 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR1P32246 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms