Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA9P31269 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXA9P31269 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXA9P31269 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms