Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPOP30536 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPOP30536 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPOP30536 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPOP30536 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms