Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK1P29120 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK1P29120 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms