Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD38P28907 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD38P28907 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD38P28907 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD38P28907 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD38P28907 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CD38P28907 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD38P28907 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD38P28907 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD38P28907 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD38P28907 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD38P28907 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD38P28907 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD38P28907 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD38P28907 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms