Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PEX2P28328 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PEX2P28328 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PEX2P28328 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PEX2P28328 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PEX2P28328 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms