Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VARSP26640 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VARSP26640 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VARSP26640 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VARSP26640 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VARSP26640 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VARSP26640 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VARSP26640 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VARSP26640 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VARSP26640 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VARSP26640 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VARSP26640 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VARSP26640 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VARSP26640 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VARSP26640 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VARSP26640 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms