Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTAFRP25105 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTAFRP25105 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms