Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GCSHP23434 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GCSHP23434 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms