Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 ALAD-203ENST00000448137 536 ntTSL 418.79■□□□□ 0.68e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-ACY1-210ENST00000636029 740 ntTSL 518.74■□□□□ 0.598e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-206ENST00000497864 802 ntTSL 218.54■□□□□ 0.568e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 LMF2-205ENST00000507607 605 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MEN1-213ENST00000440873 1107 ntTSL 518.09■□□□□ 0.498e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.418e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.398e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.358e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 317.2■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.17■□□□□ 0.348e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-205ENST00000554059 1763 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.328e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 LMF2-204ENST00000505981 824 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 316.9■□□□□ 0.38e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-204ENST00000529590 610 ntTSL 316.79■□□□□ 0.288e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MEN1-214ENST00000450708 922 ntTSL 516.76■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MEN1-212ENST00000429702 944 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.268e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ST6GALNAC4-207ENST00000495983 1362 ntTSL 516.34■□□□□ 0.218e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PLD3-220ENST00000599353 332 ntTSL 316.31■□□□□ 0.23e-20■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 216.17■□□□□ 0.188e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-205ENST00000464749 563 ntTSL 416.09■□□□□ 0.178e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MEN1-210ENST00000413626 870 ntTSL 315.95■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 515.73■□□□□ 0.118e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.048e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.048e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.036e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 08e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PYCR2-202ENST00000446534 1341 ntTSL 214.94□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ST6GALNAC4-203ENST00000467674 812 ntTSL 214.73□□□□□ -0.058e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 214.6□□□□□ -0.078e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 INCENP-203ENST00000528037 1372 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.088e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.098e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-213ENST00000595880 597 ntTSL 414.2□□□□□ -0.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.148e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-208ENST00000476309 748 ntTSL 314.14□□□□□ -0.158e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MEN1-211ENST00000424912 816 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.158e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.158e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.158e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAIP1-203ENST00000435773 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.7□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-212ENST00000531332 561 ntTSL 213.69□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-212ENST00000593686 537 ntTSL 413.67□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PYCR2-205ENST00000472798 422 ntTSL 213.6□□□□□ -0.232e-29■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.258e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.256e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PLD3-209ENST00000475983 731 ntTSL 213.37□□□□□ -0.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 VMP1-217ENST00000593168 558 ntTSL 313.34□□□□□ -0.278e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.288e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-206ENST00000468504 851 ntTSL 513.25□□□□□ -0.298e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 313.18□□□□□ -0.38e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CLPTM1-208ENST00000588274 805 ntTSL 213.08□□□□□ -0.328e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACO2-205ENST00000478010 644 ntTSL 212.48□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ABHD14A-205ENST00000494478 626 ntTSL 312.35□□□□□ -0.438e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-207ENST00000555840 2377 ntTSL 212.23□□□□□ -0.458e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.478e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 211.55□□□□□ -0.568e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.566e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ADM-204ENST00000526492 641 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.578e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CRELD1-207ENST00000465716 889 ntTSL 211.46□□□□□ -0.578e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TFF3-202ENST00000398431 452 ntTSL 311.45□□□□□ -0.588e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-207ENST00000482001 562 ntTSL 411.4□□□□□ -0.588e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.598e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.68e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 HLA-B-254ENST00000497377 917 nt11.2□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-203ENST00000538956 1264 ntTSL 211.2□□□□□ -0.628e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-203ENST00000380154 1624 ntTSL 210.84□□□□□ -0.678e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-207ENST00000493905 1358 ntTSL 510.78□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 TFF3-203ENST00000489676 419 ntTSL 210.78□□□□□ -0.688e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 510.76□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 UBXN8-209ENST00000620074 1058 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.698e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 GLA-204ENST00000479445 793 ntTSL 210.68□□□□□ -0.78e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CPT1A-204ENST00000538994 617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 DGAT2-205ENST00000603865 2678 ntTSL 210.63□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-205ENST00000526156 1024 ntTSL 210.6□□□□□ -0.718e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 STIM1-206ENST00000526596 1214 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 DGAT2-204ENST00000603363 5926 ntTSL 210.5□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ACO2-206ENST00000481310 330 ntTSL 310.49□□□□□ -0.738e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.748e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 MAN2B1-202ENST00000433513 560 ntTSL 410.4□□□□□ -0.748e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-207ENST00000517518 1597 ntTSL 1 (best)10.39□□□□□ -0.758e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 ALAD-208ENST00000482847 3247 ntTSL 210.26□□□□□ -0.778e-6■■■■■ 30.2
RPS3P23396 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.798e-6■■■■■ 30.2
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