Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TUBG1P23258 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TUBG1P23258 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms