Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNA5P22460 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms