Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NF1P21359 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NF1P21359 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NF1P21359 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NF1P21359 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NF1P21359 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NF1P21359 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms