Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATF4P18848 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATF4P18848 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF4P18848 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF4P18848 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATF4P18848 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATF4P18848 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATF4P18848 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATF4P18848 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms