Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GM2AP17900 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GM2AP17900 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GM2AP17900 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GM2AP17900 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GM2AP17900 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GM2AP17900 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GM2AP17900 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GM2AP17900 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms