Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN2P17706 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN2P17706 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms