Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GAP43P17677 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GAP43P17677 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GAP43P17677 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAP43P17677 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GAP43P17677 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GAP43P17677 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GAP43P17677 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GAP43P17677 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GAP43P17677 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms