Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMPD1P17405 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMPD1P17405 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMPD1P17405 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms