Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB3P16520 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB3P16520 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB3P16520 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms