Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDGFRAP16234 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDGFRAP16234 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms