Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ACADSP16219 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSP16219 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ACADSP16219 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACADSP16219 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACADSP16219 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACADSP16219 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACADSP16219 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACADSP16219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACADSP16219 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms