Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GATA1P15976 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GATA1P15976 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATA1P15976 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATA1P15976 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA1P15976 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATA1P15976 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms