Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCG2P13521 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCG2P13521 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCG2P13521 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCG2P13521 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCG2P13521 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCG2P13521 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCG2P13521 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms