Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKBP12277 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKBP12277 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKBP12277 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKBP12277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKBP12277 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKBP12277 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKBP12277 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKBP12277 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKBP12277 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKBP12277 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms