Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT3P12035 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT3P12035 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT3P12035 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT3P12035 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT3P12035 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT3P12035 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT3P12035 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT3P12035 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT3P12035 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT3P12035 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms