Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MS4A1P11836 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MS4A1P11836 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms