Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRFP11831 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRFP11831 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRFP11831 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRFP11831 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRFP11831 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRFP11831 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRFP11831 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRFP11831 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms