Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CDK4P11802 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDK4P11802 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDK4P11802 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK4P11802 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK4P11802 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms