Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ESRRAP11474 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ESRRAP11474 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms