Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRM1P11229 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRM1P11229 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms