Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSIG8P0DPA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VSIG8P0DPA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms