Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RGPD2P0DJD1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RGPD2P0DJD1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RGPD2P0DJD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms