Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOP08100 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOP08100 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOP08100 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOP08100 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RHOP08100 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOP08100 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOP08100 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOP08100 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOP08100 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOP08100 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOP08100 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RHOP08100 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOP08100 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOP08100 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOP08100 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOP08100 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOP08100 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms