Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB1P08034 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB1P08034 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB1P08034 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB1P08034 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB1P08034 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB1P08034 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GJB1P08034 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GJB1P08034 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms