Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F13A1P00488 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F13A1P00488 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F13A1P00488 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
F13A1P00488 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F13A1P00488 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F13A1P00488 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F13A1P00488 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F13A1P00488 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F13A1P00488 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F13A1P00488 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F13A1P00488 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F13A1P00488 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F13A1P00488 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms