Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX11BO96011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEX11BO96011 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEX11BO96011 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms