Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUDT3O95989 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUDT3O95989 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms