Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYF2O95926 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYF2O95926 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYF2O95926 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYF2O95926 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYF2O95926 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYF2O95926 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYF2O95926 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYF2O95926 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYF2O95926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms