Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPTXRO95502 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPTXRO95502 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms