Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTDNEP1O95476 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms