Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNUPNO95149 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNUPNO95149 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNUPNO95149 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNUPNO95149 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SNUPNO95149 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNUPNO95149 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNUPNO95149 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNUPNO95149 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNUPNO95149 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNUPNO95149 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms