Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPM3O75607 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPM3O75607 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPM3O75607 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPM3O75607 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPM3O75607 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPM3O75607 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPM3O75607 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NPM3O75607 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NPM3O75607 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NPM3O75607 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPM3O75607 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPM3O75607 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPM3O75607 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NPM3O75607 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NPM3O75607 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NPM3O75607 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NPM3O75607 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms