Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2F6O75461 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
E2F6O75461 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F6O75461 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F6O75461 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F6O75461 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
E2F6O75461 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F6O75461 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F6O75461 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms