Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP9AO75110 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP9AO75110 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP9AO75110 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms