Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC22O60826 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC22O60826 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms