Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAB2O43741 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAB2O43741 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms