Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCXO43602 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCXO43602 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCXO43602 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCXO43602 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCXO43602 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCXO43602 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCXO43602 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCXO43602 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCXO43602 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCXO43602 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCXO43602 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCXO43602 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCXO43602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms