Protein–RNA interactions for Protein: O43353

RIPK2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK2O43353 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPK2O43353 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPK2O43353 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms